A PUCRS é a melhor Universidade privada da Região Sul e a 3ª do País segundo o Índice Geral de Cursos (IGC) 2012, do Ministério da Educação (MEC), que avalia a qualidade dos cursos de graduação, mestrado e doutorado. O conceito IGC Contínuo foi de 3,53, na faixa 4, em uma escala de 1 a 5. O cálculo do IGC inclui a média ponderada do Conceito Preliminar de Curso (CPC) e os conceitos da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (Capes), responsável por avaliar os programas de pós-graduação das instituições.

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O CPC avalia o rendimento dos estudantes, a infraestrutura da instituição, a organização didático-pedagógica e o corpo docente.