O Instituto integra o Centro Paulista de Pesquisa em Bioenergia, idealizado em 2009 pela Diretoria Científica da FAPESP.
O governo do Estado de São Paulo financia a infraestrutura, as universidades investem na contratação de recursos humanos e a FAPESP apoia os projetos de pesquisa.
Cada universidade adotou um modelo diferente. A Unesp decidiu criar o IPBEN para que as pesquisas em bioenergia da instituição ganhassem em produtividade e qualidade, com investimentos de R$ 9,6 milhões do governo do Estado de São Paulo.
O IPBEN é formado por um Laboratório Central, instalado em Rio Claro, e outros sete laboratórios associados nas cidades de Jaboticabal, Guaratinguetá, Ilha Solteira, Botucatu, Assis, Araraquara e São José do Rio Preto.
Está prevista, ainda, a inauguração dos laboratórios associados em Araraquara, Botucatu, Ilha Solteira e São José do Rio Preto.
Agência FAPESP